FCSalyzer官方版

FCSalyzer简介

FCSalyzer提供细胞数据分析功能，可以在软件分析中加入FCS类型的数据，让用户更直观的查看数据，方便在电脑上分析细胞。本软件基于Java开发，软件为jar格式。在启动软件之前，需要确保计算机已经安装了JRE来获取jdk环境，以便FCSalyzer。jar可以直接启动。进入主程序后，可以查看数据分析界面。分析参数可以通过将流式细胞仪数据或流式细胞仪数据加载到软件中来设置，分析结果可以通过函数图像显示，细胞数据可以通过正弦函数图像显示。软件支持多种流式细胞仪，并提供Partec流式细胞仪、Stratedigm流式细胞仪和Sysmex乘数分析仪，均可加载到软件中查看！

FCSalyzer软件功能

FCSalyzer可以打开来自不同血细胞计数器和血细胞计数器软件的各种FCS数据文件格式。用户可能需要将相应采集软件的数据文件导出到FCS标准(FCS3最好)。

便携式血细胞计数器的大多数数据文件似乎都可用:

-BD-迄今为止所有经过测试的机器，包括Accu

-Cytek

-热科学调谐

-贝克曼库尔特:青色，细胞组学FC 500，加利奥斯，XL(系统二)

-贝克曼库尔特:莫弗洛:用户应该小心FCSalyzer正确打开文件。

-索尼iCyt Eclipse

-密理博番石榴:可能工作不稳定。

-miltenyi MacQuant:用户应小心FCSalyzer正确打开文件。

-伙伴通行证

–战略m S1400

–宝石软件

–Sysmex倍性分析仪

给出了Logicle数据标度及其倒数的实现。Logicle数据标度是反双曲正弦函数或反正切函数的扩展。正如arcsinh对于大数据值是对数的一样，它在零附近是线性的，在零附近是对称的，并且在对数和线性区域之间平滑地变化。更一般地，可以控制线区域的宽度。通过选择几十个要覆盖的数据范围、刻度中的最大数据值和线条区域的宽度，可以参数化刻度。用于流式细胞仪中，其中有最适合对数刻度的大动态范围数据，也有分布在零附近且包含负值的其他数据，但普通对数刻度不适合这种数据。

FCSalyzer软件特色

分析FCS2和FCS3列表模式文件。

你看到的就是你得到的& # 8211；该图放置在分页文档上。

位图、密度图和直方图& # 8211；所有这些都包括在内。

图纸可以用它们的统计数据复制。

FCSalyzer使用说明

我对FCS数据文件的理解

有两个标准，FCS2和FCS3(以及FCS3.1)。主要区别在于FCS3中的其他和关键词。

更重要的是，如何在FCS文件中存储数据。数据可以存储为“I”，表示整数数据。这里，这些值代表测量事件的通道。重要的是，数据可以按行或对数存储。在后一种情况下，关键字($ PxE)定义了对数标度，用于在存储数据之前收集和对数转换数据。其他主要数据类型是“f”。这里，所有值都以浮点数据的形式线性存储。FCS标准不允许以对数形式存储“f”数据。因此。$ PxE关键字必须是“0，0”。FCS标准允许其他数据格式:“A”表示Ascii数据，“D”表示以双精度存储的数据。到目前为止，我还没有遇到过这样的文件，所以FCSalyzer不支持。数据可以与“增益”值(关键字$ PxG)相关联。根据标准，增益是指数据在保存到FCS文件之前的放大。不幸的是，我无法正确理解这个值在软件测试的FCS示例文件中的用法。一些文件似乎期望存储的值被相乘，而另一些文件被$ PxG值除。我可能误解了他们。因此，FCSalyzer忽略$ PxG的值。

数据可以用三种不同的方式存储(关键字$ Mode)。“L”表示事件列表。这是最常见的数据模式。“C”和“U”用于将直方图存储在FCS文件中。我从未遇到过这样的文件。FCSalyzer仅支持“L”模式数据文件。

一个FCS文件可能包含多个数据集。FCSalyzer仅支持文件中的第一个数据集。

流式细胞仪

Cell Quest: Cell Quest (Cell Quest P)是一款用于FACScan、FACS Calibur等细胞计数仪器的采集软件。它以FCS2格式保存数据文件。FCSalyzer可以很好地打开这些文件。这些文件中有一个错误:对数刻度的定义($ PxE)通常设置为& # 8217；4,0’从技术上讲，这是FCS标准定义的错误。标准建议将该值视为“4，1”，并且FCSalyzer将会这样做。

FACS Diva:FACS Diva是LSR-II、Canto、Fortessa等机器的采集软件。这些文件似乎正常打开。然而，在Aa-II上生成的用于软件测试的FCS中的一个示例文件定义了对数标度($ PxE)，即使它是浮点数据文件。在这些情况下，FCSalyzer会忽略$ PxE。

Accu:FCSalyzer可以从Accu C6打开FCS文件。

FACS分类软件:该软件用于inFlux分类器。原则上，文件是可以读取的。但是，FCS中用于软件测试的示例文件在参数Time中有一个特殊的数字。从65062开始，时间增加到65535，减少到0，并增加到文件中最后一个事件的1571。

米尔顿伊生物流式细胞仪

苹果电脑上的苹果电脑识别:

MQD文件:MQD是MACSQuant的原生数据格式。它们原则上遵循FCS格式，可以在FCSalyzer中打开。然而，数据存储的数量非常少，通常在0到1之间。在进一步处理之前，MACSQuant似乎会将所有数据乘以1000，所以FCSalyzer会这样做。然而，我不确定我是否完全理解MQD格式。强烈建议用户验证MQSa数据文件是否按照FCSalyzer的预期进行了处理。

FCS文件:MACSquant也可以将数据导出为FCS文件。它提供了各种导出选项。请仔细告知用户哪个选项最适合FCSalyzer。可以在FCS中打开FCS文件进行软件测试。这包含三个FCS文件，它们似乎是从具有不同设置的相同数据中导出的:

FCS 30文件包含负无穷大的事件。FCSalyzer将这些值更改为简单的零以显示数据。计算时不会更改数据。

“FCS 30”和“FCS31”文件的事件值大于相应参数的指示范围。FCSalyzer将这些值更改为显示范围内的值。计算时不会更改数据。

-好像“FCS 30c”文件没有问题。

统计和补偿可能无法提供预期的结果，因为数据不会因计算而改变。强烈建议用户仔细导出FCS文件，看看它是否在FCSalyzer中提供了预期的结果！