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BIO-RAD CFX Maestro简介
CFX Maest提供PCR数据分析功能,可以在软件中加载数据进行图形化分析,并以条形图、聚类图、散点图、热度图或火山图的形式显示数据,可以更直观地查看分析结果。软件启动后会显示向导界面,可以根据提示的向导流程创建数据分析项目,结合板卡功能可以进行各种分析。CFXMEAEST软件为创建平板提供了两个选项:用于实时PCR的平板编辑器和用于标准化基因表达分析的设置向导。该编辑器包含分配给板孔的标准荧光团和样品类型,可以设置基因表达分析的参考目标和对照样品,可以在运行前、运行中或运行后编辑板设置,可以保存板文件以供重复使用,并且可以将板文件打印到默认打印机!
O-RAD CFX Maest软件功能
CFX Maest软件是一款易学易用的综合工具套件,用于收集和分析来自CFX系列实时PCR系统的实时PCR数据。Cfmeist软件简化了实时PCR数据的设置板、数据采集、数据分析和数据可视化的过程。
CFX Maest软件的主要功能:
1.数据t检验的统计分析和单向方差分析
2.高分辨率图形和数据可视化工具-查看各种格式的数据,包括条形图、方框图、集群图和火山图,编辑和注释图表,编辑颜色和以任何分辨率导出。
3.设计复杂的实验-用技术复制品和生物组设置你的印版,用彩色编码的印版布局轻松检查你的分组和复制。
4.参考基因选择工具-检查基因稳定性,快速确定最稳定的参考基因供您确定。
5.多板研究分析-将多个运行组合在一起,一次分析多板研究中的所有数据。
6.PmePCR的分析和集成-将PmePCR操作文件拖放到CFX Maest中,导入PME PCR板图和操作条件,使用附带的控件快速实现操作的质量控制。
O-RAD CFX Maest软件特色
使用CFXMaest软件,您可以执行以下任务:
使用启动向导快速轻松地设置实时聚合酶链反应实验。
使用条形图、聚类图、散点图、热度图或火山图来分析数据,以便快速解释和理解您的结果。
自定义您的数据表示并导出高分辨率地图以用于发布和报告生成。
使用PmePCR分析控制来确定核糖核酸质量并排除实验故障。
选择合适的参考基因,并使用参考基因选择工具分析其稳定性。
进行统计分析,包括单向方差分析基因表达分析。
自动生成每个通过/失败结果的PDF报告,以帮助评估仪器的性能。
O-RAD CFX Maest安装方法
1.打开CFXMaestSetupV4.1.exe进行直接安装,然后单击安装。
2.提示软件安装进度条,等待软件安装结束。
3.安装完成后,将打开O-RAD CFX Maest。
4.提示协议自动编写程序& # 8230;Ta计算器& # 8230;染料校准向导,重新安装仪器驱动程序
5.现在软件可以正常使用了。
O-RAD CFX Maest教程
主窗口
CFX Maest软件将打开“主页”窗口并显示“启动向导”,您可以在其中设置实验、执行或重复运行或分析现有运行。在主页窗口中,您还可以查看应用程序和仪器日志,创建和管理用户,以及访问几个有用的工具。
插入渐变步骤
1.确认梯度板的尺寸与仪器的块型(孔或384孔)相同。
2.如果您还没有这样做,请选择梯度板尺寸:选择“工具”>:梯度计算器,从下拉列表中选择适当的孔类型。
3.在工具栏上,从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。
4.在图形或轮廓窗格中,选择计划插入渐变步骤之前或之后的步骤。
5.在左窗格中,单击“插入渐变”。新的渐变步骤在图形和轮廓窗格中突出显示,例如:
插入熔化曲线步骤
提示:您不能在GOTO循环中插入熔化曲线步骤。注:熔化曲线步骤在步骤开始时保持30秒,方案中未显示。
插入熔化曲线步骤
1.在工具栏上,从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。
2.在图形中,选择插入熔化曲线的计划步骤之前或之后的步骤。
3.在左窗格中,单击“插入熔化曲线”。新的熔化曲线步骤在图形和轮廓窗格中突出显示,例如:
4.要编辑熔化温度范围或增量时间,请在图形或轮廓窗格中选择默认值并输入新值。
5.单击确定,然后单击是保存更改。
或者增加或删除印版读取步骤。
提示:将读版命令添加到步骤后,选择步骤后,按钮将变为“移除读版”。
将板添加到步骤
1.在工具栏上,从“插入步骤”下拉列表中选择“之前”或“之后”。
2.在图表上,选择计划插入印版读取步骤之前或之后的步骤。
3.在左窗格中,单击将纸板读数添加到步骤,将纸板读数添加到所选步骤。
4.单击确定,然后单击是保存更改。
删除步骤中读取的板。
在图表上,选择包含印版读数的步骤,然后单击左侧窗格中的删除印版读数。
更改步骤选项
更改所选步骤的步骤选项
1.在图表或大纲窗格中选择目标步骤。
2.在左窗格中,单击步骤选项打开步骤选项对话框。或者,右键单击任意窗格中的目标步骤,并从出现的菜单中选择步骤选项。
3.要添加、修改或删除选项:
在适当的文本框中输入一个值。
编辑特定文本框中的值。
或者选择清除复选框。
4.单击确定保存更改并关闭步骤选项对话框。
5.单击确定,然后单击是保存协议。
删除步骤
重要提示:您无法撤消此功能。删除步骤时请多加注意。
删除协议中的步骤
1.在图形或轮廓窗格中选择一个步骤。
2.在左窗格中,单击删除步骤删除选定的步骤。
3.单击确定,然后单击是保存协议。
复制、导出或打印协议
复制协议
右键单击协议大纲,然后选择复制协议。
您可以将大纲粘贴到. txt文件中。xls,。医生或。ppt文件。
导出协议
1.右键单击协议大纲,然后选择导出协议。将出现“另存为”对话框。
2.(可选)在Windows资源管理器中,导航到要保存协议文件的文件夹。
3.在文件名中,键入导出的协议文件的名称。
4.单击保存。打印协议
右键单击协议大纲,然后选择打印。
您可以将协议大纲打印到默认打印机。
使用Ptocol自动Wter创建协议
重要提示:博乐公司不保证在运行Ptocol AutoWter创建的协议时,PCR产品会一直生产。
cfmaest的Ptocol AutoWter会根据以下输入参数自动生成循环协议:
放大器长度-聚合酶链反应产物的预期长度
退火温度-如果所用引物的反应Ta未知,可以使用Ta计算器根据引物序列自动计算Ta。注:Ta是根据引物的熔化温度(Tm)来调整的,这是基于所选的酶和工作速度。
酶的类型-脱氧核糖核酸聚合酶(iTaq、iPof脱氧核糖核酸聚合酶或其他)。如果您使用ITAQ或IPOF DNA聚合酶以外的酶,您可以输入其他酶,包括梯度范围、热启动激活时间(以秒为单位)和最终扩增时间(以秒为单位)。
操作速度-反应速度(标准、快速或超快速)
Colautowter协议根据选定的速度设置优化协议。总运行时间由步骤和循环的数量、每个步骤的培养时间以及在目标温度下达到均匀性所需的时间决定。
通过输入参数和标准的聚合酶链反应指南,Ptocol AutoWter将自动生成一个定制的聚合酶链反应方案,包括热启动、初始改变、退火和延伸步骤。,您可以查看建议协议的图形表示,并编辑、运行或保存协议。
使用CFX Maest的Ptocol AutoWter创建一个新的协议。
1.在主窗口中,选择工具>:自动协议编写程序。
将出现“协议自动编写器”对话框。
2.在“输入目标值/酶”部分,执行以下操作:
如果已知,输入底漆的退火温度(Ta)。
输入碱基对中扩增子的长度(bp)。
从选项列表中选择一种酶类型(iTaq脱氧核糖核酸聚合酶、iPof脱氧核糖核酸聚合酶或其他)。
提示:如果选择“其他”作为酶类型,“其他参数(可选)”部分中的参数将激活。
3.如果选择“其他”作为酶类型,可以将以下任何或所有参数添加到方案中:
梯度范围
热启动激活温度
最终延期时间
4.在类型部分,移动滑块选择协议速度(标准、快速或超快速)。Cfmaest将调整总运行时间。
5.选择要进行的聚合酶链反应类型(默认为实时聚合酶链反应)。通过实时PCR,CFX Maest增加了读板步骤,采集荧光数据。
6.在预览部分,查看协议。您可以根据需要进行更改。
7.请执行以下操作之一:
单击确定保存新协议。保存后,协议将在启动向导中打开。单击“编辑选择”对协议进行任何更改。例如,您可能需要更改盖子温度和样品大小。
单击取消关闭窗口,不保存协议。
使用Ta计算器
1.要打开Ta计算器,请执行以下任一操作:
如果您当前在Ptocol自动Wter中,请单击Ta计算器。
在主窗口中,选择工具>:计算器。出现Ta计算器对话框。
2.在正向引物文本框中,键入或粘贴正向引物序列。
提示:您也可以使用对话框左侧的A、T、G和C按钮来输入序列。
3.在反向引物文本框中键入或粘贴反向引物序列。
4.单击计算。
Ta计算器计算并显示每种底漆的Tm和平均Tm和Ta值,例如:
如果引物的Tm值之差超过4°C,Ptocol AutoWter将使用较低的引物Tm值+2°C作为计算Ta值的基础,可以通过改变酶和反应速度进一步修改。Ta计算器使用iTaq DNA聚合酶生成标准速度的退火温度。当使用其他酶时,速度设置将自动调整Ta。
5.请执行以下操作之一:
如果从自动协议编写器中打开Ta计算器,请单击“确定”。您将返回到协议自动编写器。退火温度将自动修改。
如果从“工具”菜单打开Ta计算器,请记录计算并单击“取消”关闭计算器。
通过启动向导打开新的电路板文件。
1.在主窗口中,执行以下操作之一打开启动向导(如果它不在视图中):
选择视图>启动向导。
单击工具栏上的启动向导。默认情况下,启动向导显示“运行设置”选项卡,并且选择了CFX仪器。
2.如有必要,从下拉列表中选择仪器类型。
3.要创建新板,请单击用户定义作为操作类型。运行设置对话框打开,并显示协议选项卡。
4.单击板选项卡,然后单击新建。
板编辑器窗口打开,显示所选乐器的默认板布局。
从“运行设置”对话框中打开一个新的板文件。
1.在主窗口中,执行以下操作之一以打开“运行设置”对话框:
选择运行>用户定义的运行。
单击工具栏上的用户定义的运行设置。
运行设置对话框打开协议选项卡。
2.要创建新板,请单击“板”选项卡,然后单击“新建”。
板编辑器窗口打开,显示所选乐器的默认板布局。
在印版编辑器中打开现有的印版文件。
CFX Maest软件提供了一个样本板文件,您可以将其编辑并保存为新板。您也可以从以前保存的电路板文件创建新的电路板文件。打开样品板文件
1.在主窗口中,选择文件>:打开>平板
Windows资源管理器将打开CFX Maest示例文件文件夹的位置。
2.打开“样品文件”文件夹和“样品板”文件夹。
3.选择选定的板,然后单击打开。样品板文件在板编辑器窗口中打开。
4.选择文件>另存为,以新名称或文件夹保存纸板文件。
打开以前保存的纸板文件
1.在主窗口中,执行以下操作之一:
选择文件>“打开”>电路板,导航并选择目标电路板,然后点按“打开”。
打开向导并执行以下操作之一:
要编辑现有的印版文件,请单击“选择现有文件”并导航到目标文件。
要编辑显示的板文件,请单击“编辑选定对象”。
目标板在板编辑器窗口中打开。
2.选择文件>另存为,以新名称或文件夹保存纸板文件。
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