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Hyperchem简介
Hyperchem是一款专业的分子模拟软件。Hyperchem使用最新版本时,可以输入结构,读取数据文件框,直接作为文本,以球、棒及其混合模式等不同方式显示分子。Hyperchem版本支持的计算方法有从头计算、半经验方法、分子力学、混合计算等。,还支持用户自定义的外部程序。
基本简介
Hyperchem是一个分子模拟软件,以其高质量、灵活性和易操作性而闻名。可以通过3D全面计算量子化学。它有方便的仿真工具和漂亮的图形界面。可以用量子化学的半经验方法(AM1,PM3等)计算。),从头计算方法(超高频,RHF,CI等。)和密度泛函方法,并能进行单点能量。
功能介绍
1.输入结构,读取数据文件框,直接制作文本,以球、棒及其混合模式等不同方式显示分子;
2.使用量子化学或经典势能面方法。执行单点、几何优化和过渡态搜索计算。
3.支持的计算方法有:从头计算、半经验方法、分子力学、混合计算等。
4.支持用户定制的外部程序;
5.其他模块:PAYTRACE模块、RMSFit、序列编辑器、水晶结构器、糖结构器、构象搜索、QSAR特效、脚本编辑器;
6.新力场方法:Amber2,Amber3,Amber,Amber94,用户糖的Amber;
等等& # 8230;…
使用方法
hyperchem的基础工作
首先,画原子
1.打开“元素表”对话框。有两种方法:
在“构建”菜单中选择“Deflt元素”,或者双击绘图工具。“缺省元素”对话框允许您从周期表中选择缺省元素。
2.如果你点击属性& # 8230;按钮,将显示当前所选元素的物理种类。也很好
按住Shift键的同时点击元素按钮,结果是一样的。单击OK键,物理框消失。
3.如果“允许离子”或“显式水力”处于打开状态(打勾选择),左键单击这些选项将其关闭。
4.在默认元素列表中选择碳,然后关闭元素对话框。默认元素将设置为碳。当然也可以去掉打开Deflt元素对话框,这样就可以看到HyperChem工作区了。这在绘制含有大量原子的分子时非常有效。
5.左键单击绘图工具,将指针移动到工作区。
6.左键点击工作区左下角,会出现一个小圆圈,代表未键合的碳原子。
7.在工作空间的不同位置绘制更多的原子。
第二,画出价格键
1.将指针移动到刚画出的第一个碳上。
2.按下鼠标左键。这是第一个原子中价键的位置。
3.按住鼠标键,拖动到工作区的顶部。
4.松开鼠标按钮。这是第二个原子中价键的位置。一条线代表两个碳原子之间的价键。
5.使用仍停留在price键末端的指针,用左键将其拖动到工作区的右下角。
6.松开鼠标按钮。这是第三个原子的位置。
7.在空白工作区画六个价键组成一个环。
现在你知道怎么画原子和分子了,也学会了一些基本功。
第三,选择原子
在本练习中,您可以通过选择原子来学习基本的选择技巧。首先,必须设置选定的能级[原子、残基或分子],这里设置为原子。
1.左键单击选择菜单。
2.左键单击以选择原子。
接下来,关闭多重选择:
1.左键单击选择菜单。
2.如果多重选择处于打开状态,单击鼠标左键将其关闭。
所以当你重新选择一个原子或者一组原子的时候,之前的选择就会被取消。
第四,删除原子
1.左键单击绘图工具进入绘图模式。
2.右键单击要删除的原子,或要删除的价键中间。原子的价键会消失。
更新志
1.OpenGL绘图:基本演示模式完全转换为全新的OpenGL模式,使得分子演示图形质量更高。
2.支持自定义颜色:1600万色取代传统的八种标准色。
3.混合演示:棒状、球状或组合式分子演示手段可用于演示分子的任何原子和片段。
4.原子& # 8221;类型& # 8221;演示:全新的原子& # 8221;类型& # 8221;演示:全新的原子& # 8221;类型& # 8221;示范。
5.增强了蛋白质建模功能,支持各种蛋白质二级结构演示和大分子的电子密度近似方法。
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